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SFB 1664 D02
Entwicklung von SNPstar 2.0 und einer bioinformatischen Vorhersage von Proteoformen mit funktioneller Variation (D02)
| Coordinator | Professor Dr. Ivo Große ; Professor Dr. Marcel Quint |
| Grant period | 2024 - |
| Funding body | Deutsche Forschungsgemeinschaft |
| DFG | |
| Identifier | G:(GEPRIS)545537056 |
⇧ SFB 1664: Diversität pflanzlicher Proteoformen - SNP2Prot ⇧
Note: Das Genomics-basierte D02 zielt auf die Entwicklung von SNPstar 2.0 und die Vorhersage von Proteoform-Kandidaten mit hoher funktioneller Variation auf der Grundlage genomischer Daten ab. Das mit Strukturmodellen aus D01 erweiterte SNPstar 2.0 wird ausserdem die nsSNPs auf der Struktur abbilden und auf andere Pflanzenarten ausgeweitet. Das Projekt wird einen quantitativen Score für SNP-Effekte auf Struktur und Funktion von Proteoformen einführen. Dieser Score unterstützt Auswahl von funktionell divergenten Proteoformen für die experimentelle Analyse in der zweiten Förderperiode.