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SFB 902 A09
Molekulare Simulationen von RNA-Faltung und Funktion (A09)
| Coordinator | Professor Dr. Gerhard Hummer |
| Grant period | 2015 - 2023 |
| Funding body | Deutsche Forschungsgemeinschaft |
| DFG | |
| Identifier | G:(GEPRIS)274038265 |
⇧ SFB 902: Molekulare Mechanismen der RNA-basierten Regulation ⇧
Note: In der biophysikalischen Beschreibung von RNA gewinnt die Erforschung des Zusammenhangs von Struktur, Dynamik und Funktion in vivo zunehmend an Bedeutung. Jüngste Experimente zeigten eine unerwartete Strukturausbildung im RNA Transkriptom, die auf regulative Aufgaben wie beispielsweise die Kontrolle des Spleißens hinweist. Unser Projekt zielt darauf hin, eine Brücke zwischen Sekundärstrukturvorhersagen und hochauflösenden Strukturdaten an RNA zu schlagen, indem wir extensive einzelsträngige RNA-Ensembles über MM (molecular mechanics) und MD (molecular simulations) mit NMR-, EPR- und Fluoreszenzspektroskopischen Experimenten verknüpfen. Wir werden das Spleißsystem SM2, das auch experimentell charakterisiert wurde, durch Kombination strukturierter und unstrukturierter Elemente untersuchen.